MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD04

Total Repeats: 602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010517	CTTT	2	8	253	260	0 %	75 %	0 %	25 %	170752138
2	NC_010517	GTC	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752138
3	NC_010517	GTT	2	6	314	319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170752138
4	NC_010517	TAGCTG	2	12	562	573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170752138
5	NC_010517	CGC	2	6	658	663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752138
6	NC_010517	CCT	2	6	703	708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752138
7	NC_010517	CAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752139
8	NC_010517	GAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752139
9	NC_010517	CGT	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752139
10	NC_010517	GCC	2	6	1421	1426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752139
11	NC_010517	CGA	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752139
12	NC_010517	CCG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752139
13	NC_010517	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752139
14	NC_010517	TCA	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752139
15	NC_010517	ATC	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752139
16	NC_010517	ATC	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752139
17	NC_010517	TCG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752139
18	NC_010517	GGC	2	6	1798	1803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752139
19	NC_010517	CAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752139
20	NC_010517	GAA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752139
21	NC_010517	TGCT	2	8	2019	2026	0 %	50 %	25 %	25 %	170752139
22	NC_010517	CGG	2	6	2071	2076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752139
23	NC_010517	GCT	2	6	2077	2082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752139
24	NC_010517	GCT	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752139
25	NC_010517	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752139
26	NC_010517	ACC	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752140
27	NC_010517	C	6	6	2493	2498	0 %	0 %	0 %	100 %	170752140
28	NC_010517	CCA	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752140
29	NC_010517	GCGAA	2	10	2518	2527	40 %	0 %	40 %	20 %	170752140
30	NC_010517	TCG	3	9	2559	2567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
31	NC_010517	CAC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752140
32	NC_010517	CGT	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
33	NC_010517	TCT	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752140
34	NC_010517	ACG	2	6	2703	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752140
35	NC_010517	CTT	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752140
36	NC_010517	GTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752140
37	NC_010517	CG	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	170752140
38	NC_010517	GCC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
39	NC_010517	CTA	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752140
40	NC_010517	TTC	2	6	2871	2876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752140
41	NC_010517	CGG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752140
42	NC_010517	CAC	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752140
43	NC_010517	CG	3	6	2925	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	170752140
44	NC_010517	GCC	2	6	2947	2952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
45	NC_010517	CAC	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752140
46	NC_010517	GCC	2	6	3042	3047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
47	NC_010517	CTCC	2	8	3091	3098	0 %	25 %	0 %	75 %	170752140
48	NC_010517	TGC	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
49	NC_010517	CGG	2	6	3226	3231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752140
50	NC_010517	CGT	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
51	NC_010517	CG	3	6	3253	3258	0 %	0 %	50 %	50 %	170752140
52	NC_010517	CGC	2	6	3295	3300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
53	NC_010517	CGT	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
54	NC_010517	GCC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
55	NC_010517	CGC	2	6	3487	3492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752140
56	NC_010517	CTG	2	6	3512	3517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752140
57	NC_010517	CCT	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752140
58	NC_010517	GCG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752140
59	NC_010517	CGC	2	6	3696	3701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
60	NC_010517	CGG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
61	NC_010517	CGG	2	6	3801	3806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
62	NC_010517	CTGC	2	8	3826	3833	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
63	NC_010517	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752141
64	NC_010517	CTGC	2	8	3862	3869	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
65	NC_010517	GCG	2	6	3945	3950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
66	NC_010517	CCG	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
67	NC_010517	CGA	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752141
68	NC_010517	AC	3	6	4025	4030	50 %	0 %	0 %	50 %	170752141
69	NC_010517	CGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
70	NC_010517	CTC	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752141
71	NC_010517	CCT	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752141
72	NC_010517	GCC	2	6	4148	4153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
73	NC_010517	CGG	2	6	4276	4281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
74	NC_010517	GCCT	2	8	4292	4299	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
75	NC_010517	GC	3	6	4478	4483	0 %	0 %	50 %	50 %	170752141
76	NC_010517	CGG	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
77	NC_010517	GCC	2	6	4636	4641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
78	NC_010517	CGT	3	9	4702	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752141
79	NC_010517	GGC	2	6	4747	4752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
80	NC_010517	CGC	2	6	4820	4825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
81	NC_010517	GTC	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752141
82	NC_010517	GCG	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752141
83	NC_010517	TCGC	2	8	4929	4936	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
84	NC_010517	CGT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752141
85	NC_010517	ATG	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752141
86	NC_010517	GCC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
87	NC_010517	TCC	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752141
88	NC_010517	CGA	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752141
89	NC_010517	CCG	2	6	5076	5081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752141
90	NC_010517	CTTGC	2	10	5118	5127	0 %	40 %	20 %	40 %	170752141
91	NC_010517	GTTT	2	8	5297	5304	0 %	75 %	25 %	0 %	170752142
92	NC_010517	TCT	2	6	5369	5374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752142
93	NC_010517	A	6	6	5400	5405	100 %	0 %	0 %	0 %	170752142
94	NC_010517	CTC	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752142
95	NC_010517	GCC	2	6	5682	5687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752142
96	NC_010517	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752142
97	NC_010517	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752142
98	NC_010517	GAC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752142
99	NC_010517	TCC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752142
100	NC_010517	GGGC	2	8	5925	5932	0 %	0 %	75 %	25 %	170752142
101	NC_010517	CGC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752142
102	NC_010517	C	6	6	5994	5999	0 %	0 %	0 %	100 %	170752142
103	NC_010517	CGAT	2	8	6007	6014	25 %	25 %	25 %	25 %	170752142
104	NC_010517	CGG	2	6	6056	6061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752142
105	NC_010517	GACG	2	8	6895	6902	25 %	0 %	50 %	25 %	170752143
106	NC_010517	AC	3	6	6939	6944	50 %	0 %	0 %	50 %	170752143
107	NC_010517	GAC	2	6	6962	6967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752143
108	NC_010517	GGAC	2	8	7017	7024	25 %	0 %	50 %	25 %	170752143
109	NC_010517	GAA	2	6	7048	7053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752143
110	NC_010517	GGC	2	6	7081	7086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752143
111	NC_010517	GCC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
112	NC_010517	CCG	2	6	7164	7169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
113	NC_010517	AGG	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752143
114	NC_010517	G	7	7	7201	7207	0 %	0 %	100 %	0 %	170752143
115	NC_010517	AGCCA	2	10	7213	7222	40 %	0 %	20 %	40 %	170752143
116	NC_010517	TCGC	2	8	7227	7234	0 %	25 %	25 %	50 %	170752143
117	NC_010517	GGGC	2	8	7236	7243	0 %	0 %	75 %	25 %	170752143
118	NC_010517	ACCG	2	8	7267	7274	25 %	0 %	25 %	50 %	170752143
119	NC_010517	CTG	2	6	7297	7302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752143
120	NC_010517	CGG	2	6	7305	7310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752143
121	NC_010517	GC	3	6	7334	7339	0 %	0 %	50 %	50 %	170752143
122	NC_010517	TGC	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752143
123	NC_010517	CCT	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752143
124	NC_010517	GGC	2	6	7422	7427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752143
125	NC_010517	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
126	NC_010517	GCC	2	6	7529	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
127	NC_010517	CCG	2	6	7545	7550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
128	NC_010517	CGC	2	6	7590	7595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
129	NC_010517	CGC	2	6	7605	7610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752143
130	NC_010517	TCAAG	2	10	8454	8463	40 %	20 %	20 %	20 %	170752144
131	NC_010517	CGC	2	6	8508	8513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752144
132	NC_010517	CCG	2	6	8957	8962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752144
133	NC_010517	ATC	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752144
134	NC_010517	TCG	2	6	9278	9283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752145
135	NC_010517	GAG	2	6	9367	9372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752145
136	NC_010517	CT	3	6	9480	9485	0 %	50 %	0 %	50 %	170752145
137	NC_010517	GAT	2	6	9492	9497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752145
138	NC_010517	CGCT	2	8	9538	9545	0 %	25 %	25 %	50 %	170752145
139	NC_010517	CGGC	2	8	9687	9694	0 %	0 %	50 %	50 %	170752145
140	NC_010517	GAA	2	6	9696	9701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752145
141	NC_010517	AGG	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752145
142	NC_010517	GGC	2	6	9723	9728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752145
143	NC_010517	GGC	2	6	9776	9781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752145
144	NC_010517	ACT	2	6	9809	9814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752145
145	NC_010517	CGTGCC	2	12	9820	9831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170752145
146	NC_010517	CGG	2	6	10150	10155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752146
147	NC_010517	CCTG	2	8	10162	10169	0 %	25 %	25 %	50 %	170752146
148	NC_010517	CGA	2	6	10196	10201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752146
149	NC_010517	GCGG	2	8	10223	10230	0 %	0 %	75 %	25 %	170752146
150	NC_010517	CA	3	6	10234	10239	50 %	0 %	0 %	50 %	170752146
151	NC_010517	GACG	2	8	10263	10270	25 %	0 %	50 %	25 %	170752146
152	NC_010517	TCG	2	6	10276	10281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752146
153	NC_010517	GCC	2	6	10308	10313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752146
154	NC_010517	CCCGG	2	10	10347	10356	0 %	0 %	40 %	60 %	170752146
155	NC_010517	AGC	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752147
156	NC_010517	GAC	2	6	10554	10559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752147
157	NC_010517	GGCTT	2	10	10560	10569	0 %	40 %	40 %	20 %	170752147
158	NC_010517	GCGA	2	8	10578	10585	25 %	0 %	50 %	25 %	170752147
159	NC_010517	CGATC	2	10	10634	10643	20 %	20 %	20 %	40 %	170752147
160	NC_010517	GGT	2	6	10659	10664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752147
161	NC_010517	CGA	2	6	10685	10690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752147
162	NC_010517	TCGGA	2	10	10750	10759	20 %	20 %	40 %	20 %	170752147
163	NC_010517	GC	3	6	10931	10936	0 %	0 %	50 %	50 %	170752148
164	NC_010517	GATC	2	8	10938	10945	25 %	25 %	25 %	25 %	170752148
165	NC_010517	GCC	2	6	10978	10983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752148
166	NC_010517	GTC	2	6	10997	11002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752148
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168	NC_010517	CGC	2	6	11128	11133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752149
169	NC_010517	GC	3	6	11164	11169	0 %	0 %	50 %	50 %	170752149
170	NC_010517	CAT	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752149
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174	NC_010517	GC	3	6	11343	11348	0 %	0 %	50 %	50 %	170752149
175	NC_010517	CGTC	2	8	11454	11461	0 %	25 %	25 %	50 %	170752149
176	NC_010517	GTG	2	6	11477	11482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752149
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180	NC_010517	CGA	2	6	11610	11615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752149
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184	NC_010517	CAT	2	6	11995	12000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752150
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198	NC_010517	GCCA	2	8	12527	12534	25 %	0 %	25 %	50 %	170752150
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245	NC_010517	GAG	2	6	16153	16158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752156
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249	NC_010517	CTT	2	6	16677	16682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752157
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252	NC_010517	GCCA	2	8	16822	16829	25 %	0 %	25 %	50 %	170752157
253	NC_010517	ACC	3	9	16849	16857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752157
254	NC_010517	GCC	2	6	16864	16869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752157
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257	NC_010517	CTC	2	6	16950	16955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752157
258	NC_010517	CGGCGC	2	12	17028	17039	0 %	0 %	50 %	50 %	170752157
259	NC_010517	TCT	2	6	17042	17047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752157
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261	NC_010517	CCG	2	6	17171	17176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752157
262	NC_010517	CGT	2	6	17184	17189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752157
263	NC_010517	GC	3	6	17223	17228	0 %	0 %	50 %	50 %	170752157
264	NC_010517	ACA	2	6	17246	17251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170752157
265	NC_010517	GGCCTG	2	12	17401	17412	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170752157
266	NC_010517	TCG	2	6	17413	17418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752157
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284	NC_010517	CGG	2	6	19504	19509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752159
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293	NC_010517	TCG	2	6	19782	19787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752159
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381	NC_010517	GCC	2	6	25543	25548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752167
382	NC_010517	GGAC	2	8	25550	25557	25 %	0 %	50 %	25 %	170752167
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386	NC_010517	CGA	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752167
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